Os desenvolvedores de Linux reconheceram o valor e a importância do AMD64 desde seu lançamento, disponibilizando sistemas operacionais de 64 bits completos em abril de 2003. Além disso, a tecnologia Java permite que os aplicativos para Linux sejam executados sem modificações no Solaris OS x86 Platform Edition otimizado para o AMD64. Atualmente, centenas de aplicativos compatíveis com Linux suportam a tecnologia AMD64.

Além de se tornar um padrão entre as comunidades científica, de infra-estrutura de TI e de engenharia, o Linux também ganhou terreno entre usuários individuais. Embora a Novell SUSE e a Red Hat sejam os maiores distribuidores de Linux, existe uma grande variedade de fornecedores regionais e específicos para determinados setores.

A AMD é membro do Open Source Development Labs (OSDL), um consórcio global dedicado a acelerar o crescimento e a adoção do Linux, bem como o apoio a soluções de computação de código aberto.