AMD與戴爾支持波蘭華沙大學生物資訊研究

搭載AMD FirePro S9150 GPU的戴爾PowerEdge伺服器提供高達1.5 petaFLOPS的運算效能,協助創新技術中心的次世代基因定序中心運用ORION超級電腦叢集執行各種OpenCL程式

台北 2015/7/3

AMD(NASDAQ:AMD)今日發表異質化高效能運算(heterogeneous high performance computing,HPC)創新成果,透過AMD FirePro™ S9150伺服器GPU,為位於波蘭華沙大學創新技術中心(Centre of New Technologies)中的次世代基因定序研究中心(Next Generation Sequencing Centre,NGSC),提供超過1.5 petaFLOPS的運算效能,支援次世代基因定序(NGS)的生物資訊研究。新建構的ORION叢集系統共有150部Dell PowerEdge R730伺服器,每部伺服器內建2顆AMD FirePro S9150伺服器GPU,單精準度運算效能達1.52 petaFLOPS,雙精準度運算效能可達0.76 petaFLOPS1。此省電叢集系統為基因資料提供快速且高效的計算效能,可廣泛運用於各種基因與生物資訊研究,在研究應用上充分發揮OpenCL™的高速與省電效率。

AMD全球副總裁暨專業繪圖部門總經理Sean Burke表示,我們致力於強化AMD在高效能運算領域的領導地位,率先提供各種運算應用程式、工具及技術。此系統的建立再次肯定了AMD於高效能運算領域的領先優勢,運用AMD FirePro S9150伺服器GPU為超級電腦叢集帶來1.5 petaFLOPS的運算效能。AMD與戴爾公司攜手打造此叢集系統,透過各種OpenCL™程式進行關鍵的科學研究。AMD深感榮幸能與戴爾以及次世代基因定序研究中心合作,共同支援如此重要的生命科學與電腦科學研究。

華沙大學創新技術中心的次世代基因定序研究中心暨生物資訊實驗室主持人Krzysztof Ginalski博士表示,我們與戴爾及AMD合作無間,在短短時間內便完成此項研究計畫。Dell PowerEdge R730伺服器的尖端科技與領先業界的系統管理功能,搭配AMD FirePro S9150伺服器繪圖方案,為ORION叢集系統建構極強大的基礎,並提供我們研究所需的各種運算功能。AMD FirePro S9150伺服器繪圖方案搭載16GB的超大記憶體容量,僅需要單顆GPU便能運行各種先進生物資訊運算,而無需跨GPU的溝通,使運作效率大幅提高。我們選擇採用多GPU的方式,讓每部伺服器上裝有兩個GPU主板,打造成本與能源效率兼顧的配置組態。

戴爾公司伺服器解決方案產品管理部門副總裁Ravi Pendekanti表示,戴爾對異質化高效能運算市場充滿熱忱,並致力支援全球頂尖研究機構與企業從事革命性的科研探索。戴爾與AMD的合作,將次世代基因定序研究中心計畫提升至全新層次,AMD FirePro S9150 GPU使Dell PowerEdge R730的威力得以發揮到其淋漓盡致。我們合力推動的次世代基因定序研究所計畫,毫無疑問將為各種關鍵異質化高效能運算應用提供頂尖效能,更同時打造優異的能源效率。

Slash sp. z o. o執行長Michał Bieńkowski表示,非常榮幸能為次世代基因定序研究中心組建異質化高效能運算叢集系統。與戴爾以及AMD之間的密切合作讓我們能在短時間內建構出高效率的解決方案。我們在幾年前投入異質化高效能運算市場,為波蘭教育領域打造各種高效解決方案。我們的目標是打造高速、可靠且省電的資料中心系統。

華沙大學創新技術中心的次世代基因定序研究中心位於波蘭華沙,針對生物、醫藥、診斷、以及治療進行尖端基因與生物資訊研究。ORION叢集系統的設計與建構目標,是為了儲存與處理該中心因基因定序而產生的超大量資料。華沙大學創新技術中心執行眾多基因研究計畫的合作案,為學界與產業界提供次世代基因定序技術。全球各地的研究人員運用該研究所進行各種次基因世代定序實驗,包含基因組、環境總體基因組、轉錄體、表觀遺傳等,協助完成許多奧妙的科學發現。創新技術中心進行的許多生物資訊研究皆依賴由ORION叢集系統所提供的極高運算效能。

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註1:測試結果是基於理論效能。ORION叢集系統中含有300個AMD FirePro S9150 GPU。根據AMD規格,單精準度運算效能最高達5.07 teraFLOPS,帶來1,521 petaFLOPS(300 x 5.07 TFLOPS)總體運算效能; 雙精準度運算效能最高達2.53 teraFLOPS,帶來0.76 petaFLOPS (300 x 2.53 TFLOPS)的總體運算效能。

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